يعتبر مرسوم إحداث المؤسسة رقم 120 لعام 2003 الصك التشريعي الناظم لعمل المؤسسة، حيث حدد المرسوم (120) رأس مال المؤسسة بـمليار ليرة سورية تضاف إليه نسبة 20٪ من أرباحها السنوية، كما حدد المرسوم بمادته السادسة مهام المؤسسة في تصدير واستيراد المواد الكيماوية والغذائية والمستلزمات الطبية وغيرها، كما تستند المؤسسة في تنظيم عقودها إلى قواعد وأحكام قانون العقود رقم 51 لعام 2004 والتعليمات التنفيذية الناظمة له.